Sanger

Descizione

Il sequenziamento Sanger (elettroforesi capillare) è basato sul nostro raffinato disegno dei primers. Dal test del portatore di mutazioni-malattia familiari fino al sequenziamento intero di piccoli geni, puoi fare affidamento sulle nostre applicazioni Sanger.

Segnali puri

Grazie al nostro scrupoloso disegno dei primer, i tracciati elettroforetici tendono al massimo della purezza di segnale nella maggior parte dei casi. Se necessario, il disegno dei primer e la PCR vengono ripetuti più volte, fino ad ottenere un segnale leggibile.

Sequenza completa o analisi di frammenti

Le nostre applicazioni Sanger vanno dalla lettura dell’intera sequenza fino al dimensionamento di frammenti.

Pseudogeni e regioni duplicate

Che sia tramite il set-up da parte del nostro team di esperti o in cooperazione con laboratori partner, siamo in grado di isolare o confermare anche varianti genetiche che cadono in pseudogeni o regioni duplicate.

Altre sequenze complesse

È possibile tentare l’approccio anche a sequenze di DNA particolarmente difficili tramite una combinazione di primer specifici, con o senza long-range PCR.

Progetti di ricerca custom

Le nostre applicazioni Sanger sono alla vostra portata anche per progetti di ricerca personalizzati, a partire da campioni in provetta singola o in piastra da 96 (96 well microplate). Le sequenze possono essere richieste sia in solo forward che in forward + reverse, con diversi tipi di deliverables: dato grezzo, bioinformatica, report con identificazione della variante.

Estrazione DNA

Estrazione e purificazione del DNA sono disponibili a partire da qualsiasi tipo di tessuto umano (cat. A) per accedere ai nostri servizi Sanger.

  • SANGER CARRIER: sequenziamento Sanger di mutazioni note per studio di segregazione familiare.
  • SANGER GENE: sequenziamento completo di geni di piccole dimensioni
  • SANGER RESEARCH: progetto di sequenziamento Sanger a partire da provetta singola o piastra da 96 campioni.

Specifiche tecniche

Metodo

Elettroforesi capillare su sequenziatore ABI in forward + reverse basato su disegno specifico dei primer. Deliverables per la clinica: Report Medico. Deliverables per la ricerca: dato grezzo (file .abi), bioinformatica, report sui genotipi.

Specifiche campione

DNA (almeno 50 ng), sangue intero in EDTA (provetta tappo viola), dried bloos spots (su card Breda Genetics), buccal swabs Breda Genetics, paraffinato. Per SANGER RESEARCH, può essere accettato qualsiasi tipo di campione (Cat. A). Spedizione del campione: a temperatura ambiente.

Tempistiche

2 settimane (in urgenza, 1 settimana)

Disponibilità

Per Professionisti e Laboratori: registrati qui per inserire il tuo 1-minute online order. Per Pazienti: inviare una richiesta a info@bredagenetics.com

Limitazioni

A causa della particolare conformazione della sequenza in alcune regioni genomiche (dovuta, ad esempio, alla presenza di un elevato contenuto GC o ad elevati tassi di omologia con altre regioni), il Sanger può fallire anche dopo ripetuti tentativi con diverse coppie di primers. In questi casi, può esseree offerta un’alternativa tramite Next Generation Sequencing (NGS) per analizzare la regione di interesse.

Consigli

Per saperne di più sul sequenziamento Sanger, leggi il nostro post.

Altro

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